Модель была обучена на данных 2 069 участников многолетнего исследования сердца Framingham и протестирована в независимых группах и клиническом испытании ограничения калорийности
Искусственный интеллект016 минут назад
Исследователи представили обновлённую версию FraminghamPACE — биомаркера, основанного на метилировании ДНК, который измеряет не биологический возраст, а скорость возрастных изменений. Работа опубликована, но пока не прошла независимую научную проверку (peer review) и не подтверждает, что этот показатель может служить клиническим индикатором эффективности лечения.
Модель была создана на основе данных Framingham Heart Study Offspring Cohort — многолетнего исследования здоровья нескольких поколений участников. Авторы адаптировали метод Pace of Aging, ранее разработанный на основе данных исследования Dunedin, для набора данных с различным возрастом участников и неодинаковыми интервалами наблюдений.
В основу модели легли изменения 17 показателей крови и функционирования органов, собранные за 8 обследований с 1971 по 2008 год.
Для создания биомаркера были использованы данные метилирования ДНК 2 069 участников и 2 модели машинного обучения. Версия на основе elastic net включала 1 123 участка CpG (области ДНК, где измеряется уровень метилирования), в то время как модель ridge regression — 14 465 участков. На отложенной выборке данных Framingham модели объясняли 47% и 46% вариации рассчитанного темпа старения соответственно.
Дополнительные проверки выявили высокую воспроизводимость измерений: в технических повторах из исследований LOLIPOP и CARDIA коэффициент согласованности превышал 0,95. Более высокие значения FraminghamPACE были связаны с меньшей продолжительностью жизни без серьёзных заболеваний и общей продолжительностью жизни в нескольких наблюдательных группах. В рандомизированном исследовании CALERIE показатель снижался у участников группы с ограничением калорийности, что соответствовало изменениям другого биомаркера старения DunedinPACE.
Тем не менее, авторы подчеркивают, что FraminghamPACE всё ещё остаётся исследовательским инструментом: для его применения в клинической практике потребуется дополнительная проверка на различных группах населения и подтверждение того, что изменение показателя действительно связано с улучшением здоровья.
Darth SaharaИсточники:letsdatascienceИскусственный интеллект0Искусственный интеллектБиомаркерыГенетические исследованияБиомедицинаЭпигенетикаМетилирование ДНК16 минут назад
Источник